厭氧發酵也叫厭氧消化或沼氣發酵，是有機物質（為碳水化合物、脂肪、蛋白質等）在一定溫度、濕度、酸堿度和密閉無氧條件下，
經過沼氣菌群發酵（消化），生成沼氣、沼液和沼渣的過程，這個過程就叫厭氧發酵。
厭氧發酵原理：厭氧堆肥發酵是在缺氧條件下利用厭氧微生物進行的腐敗發酵分解，
其最終產物除了二氧化碳和水外，還有氨、硫化氫、甲烷和其他有機酸等物質，
其中氨、硫化氫等物質有異臭氣味，而且厭氧堆肥發酵需要的時間也很長，
完全腐熟往往需要幾個月的時間。傳統的農家肥就是厭氧堆肥發酵，整個發酵過程主要分為兩個階段：
第一階段是產酸階段。產酸菌將大分子有機物降解為小分子的有機酸和乙酸、丙醇等物質。
第二階段為產甲烷階段。甲烷菌把有機酸繼續分解為甲烷氣體。
厭氧發酵過程沒有氧參加，酸化過程產生的能量較少，許多能量保留在有機酸分子中，在甲烷細菌作用下以甲烷氣體的形式釋放出來。厭氧堆肥的特點是反應步驟多，速度慢，時間長。
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